六百年前创建的多科寺
元朝萨迦巴思巴在内地期间，他在康区建立了很多土司制度。其中在昌地区（今四川省甘孜州白玉县境内）建立了万户土司，而且巴思巴还亲自巡视了整个昌地区。同时训服了该地区的土地神。当时万户土司有一位兄弟沃迦喔喇嘛，他在上昌地区的深山里创建了一所小寺庙叫迦吉日昌（即后来多科寺的前身）。寺内重要的法物有响铜制做的护法神数箱，元朝皇帝赠送的佛像数尊，还有很多其他的法物。巴思巴曾预言说： 这所寺庙的规模以后不会扩大，将来迁往到多科山之后，它就会成为萨迦派的大寺庙。后来德格第司扎西桑格当政时期，有一位名叫唐东杰波的大成就者，在德格建立了一所寺庙。同时他还到昌地区，尊照巴思巴的预言，勘查了多科山并指定了寺庙应当建立的地点。此时土地神从中作乱，唐东杰波显示神通，在一块巨石上留下了自己的身形凹印迹。（“多科”名由此而来，“多”是指石头，“科”是指凹陷的痕迹）。多科寺所在的地形，即是上乐金刚的坛城，因为他的地基是法台，天空是法轮，山势像自然形成的宫殿，宫殿的周围有八大护法神山，门前的地形像空行母的头盖骨，这正是多科寺当建之处。从沃迦喔喇嘛建寺到唐东杰波迁寺到多科山，后来又迁寺至却但多，这期间的传承及历史没有详细的文字记载。
根据唐东杰波《长寿仪轨经》里面的记载说，有一位唐东杰波的弟子叫空行母，在康区多科寺附近修行，寿命长达一百多岁。由此推测，是唐东杰波大约在公元十五世纪建立了多科寺。有关唐东杰波是如何建立多科寺及怎样在此传法等，只有口头流传，没有详细的文字记载。
自唐东杰波创建寺庙以来，德格土司每三年派一位大师到多科寺担任主持。萨迦鄂巴勘布、洛丹曲江等到多科寺来传法、灌顶等，进行了大量的弘法活动。到公元十七世纪，昌地区分出了上昌区和下昌区。上昌区有一位大成就者叫让珠，他担任多科寺的主持，并且传法，培养僧伽弟子。此后相继有了三位大师来任主持。再后来又出现了一位大成就者叫昌根江巴来主持寺庙。在此期间，德格土司照旧向寺庙派住喇嘛，从未间断。历代萨迦鄂巴勘布凡到过康区的，都要前往多科寺，进行传法、灌顶等佛事活动。
新龙第司曾毁坏了整个多科寺，后业蒋扬钦则旺波预言说，多科寺迁往却但多之后，才会兴盛昌隆。他的弟子蒋扬洛周塔易为此专门去却但多勘察地形，并指定了寺庙应当建立的地点。洛周塔易指出，该地点是一朵大莲花，对面有八大吉祥山，天是法轮，四周具有四大守护山，四隅具有四座山峰，此种地形天然妙成，是昌地区的核心位置。
德格土司有位大臣名叫迦果白玛来周，他将昌区内的财税收入再加上自己的供养金作为重建寺庙的资金。工匠、木匠、画家等各类建筑人员均从德格和昌地区招集而来。从多科山建寺到迁往却但多建寺期间经历了180年。
从深山建立迦吉日昌寺起，到后来两次先后迁至多科山和却但多止，这期间佛法的弘传及寺庙的发展前面已作了简述，其详细的情形需参阅唐东杰波及历代鄂巴勘布的传记。应当提及的是这期间出现了两位大法师，迦果喇嘛和创根活佛。其中创根活佛建立了一所山间小修行院，他自己的后半生一直在此修行。到了四世创根活佛又再次重建修行院，并在此传法修行。有关详细的历史在历世创根活佛传记里均有记载。到后来又出现了一位拉塔活佛：索南却珠。四世竹青活佛预言道：“从今往后二十年，辅音字首是其名，宁日转世在昌区”，到了1925年，那拉塔佛索南却珠果真出生在昌区，其父名叫阿旺仁钦，其母名叫萨戛多。拉塔活佛向各个教派的喇嘛全面地学习了佛法，而且还广收各个教派的弟子为徒，拉塔活佛弘法的事迹有很多。他的转世钦美仁增和迦果活佛两人在此传法30年。土地改革的前一年，拉塔活佛二世钦美仁增圆寂。1960年迦果活佛遇难圆寂。
寺庙的法式活动在解放前在夏季有胜乐金刚，密集金刚，喜金刚等修法仪轨。在冬季有大威德金刚，颇巴金刚修法仪轨。在桑珠活佛之前寺庙管家白玛拉珠，他从竹青勘布格桑木兰请来了夏令安居仪轨。拉塔活佛期间，创建了大日如来仪轨。通常胜乐金刚、密集金刚、喜金刚仪轨法会是在藏历的8月开始。大威德金刚法会在藏历12月开始。颇巴金刚法会在藏历年期间举行。藏历4月份大日如来法会开始。6月份夏令安居仪轨开始。还经常在护法神殿修供养仪轨。总共有八大法事活动。每过三年还举办一次千僧法会。同时选举寺庙内的各项法务人员。千僧主要来自昌区、昂尊、迦学等地区。千僧会上主要仪轨是颇巴金刚，多达一千三百僧人参加。每年的八大法会能集中700多僧人参加。
寺庙的经济来源主要有以下几方面：德格第司从颇塔开始历代第司对寺庙的供养；寺内僧人每年一次在昌区及其他地区的化缘所得；寺庙管家白玛拉珠之后在尊多和藏地区寺庙便拥有了自己的土地。上述经济来源用于寺庙的一切经费支出。
在拉塔活佛主寺期间，从宗萨寺请来勘布曲美讲经，当时听经的有50多僧人。后又请德雄勘布群培来讲经，并扩大了原来的讲经内容。再后来又请勘布土登任讲经院勘布，还有勘布阿贡，扎西等来继续担任勘布，直到解放前。修行院是在拉塔活佛期间创建的。他不分教派，因此修行院内广讲萨迦道果法、宁玛大圆满法等。后来勘布降泽阿然、嘎玛江永、阿康洛珠等相继担任修行院的勘布，直到解放前。
寺庙内有用黄金制成的一大尊释迦牟尼佛像、无量寿佛像、度母像，都高达3米左右。还有十六罗汉、萨迦五祖、三怙主、二十一度母，此外还有很多伏藏的佛像等一百多尊。大藏经甘珠尔有十三部，丹珠尔有四部，金粉绘制的唐卡25帧，各种乐器50件，锁呐7对，铜号7对，海螺9对，胫骨号筒5对，斋僧大锅2口，小锅10口，茶桶40只，伞幢等法物用品。这些都是解放前寺庙的情况。
在文革期间，寺庙内外遭受彻底毁坏。到1984年，政府批准重建多科寺，喇嘛阿次，勘布西然、勘布格勒等寺庙僧人和昌区群众共同组织开始重建寺庙。勘布西然精通萨迦、宁玛等教法，并恢复讲修萨迦道果、律藏等。他还有很多弟子来自木雅、理塘、德格、新龙、霍上下、昌区、乡城、德新等地区。在他们的共同努力下重建了大小两座佛堂，一座两层楼的厨房、管家楼。重塑了3米高的黄铜佛像，添置了乐器、锁呐、饶钹等寺庙需要的很多乐器、法物等。
尼玛降称活佛1942年出生在昌区，从12岁开始便在鸟喜讲修院学习。他的上师有乌坚仁增、勘布明色、昌根阿瑞等，他向这些上师主要修学了萨迦、宁玛等教法。从1985年起，在四川省新龙县阿嘎寺讲经2年。从1987年起，在昌区多科寺任夏令安居勘布3年。1990年起在他的上师昌根阿瑞仁波切修行院闭关2年。1992年起在四川省佛学院任勘布2年。1994年多科寺重建讲修院，讲堂大约有150平方米，僧舍80间，恢复了讲修院原有的佛事活动。他还担任了讲修院的勘布，常住学员有60多僧人。1999年中国藏语系高级佛学院聘请他讲经。他的弟子学员有来自云南、青海、甘肃、内蒙、四川等地的活佛和僧人。
另外多科寺还有勘布才旺嘉措、索噶喇嘛、阿贡等高僧。其他勘布活佛对多科寺的重建也做出了不少贡献。喇嘛噶桑彭措对修行院的重建也做出了贡献。
总的来说，上下昌区有名的喇嘛都出自多科寺。比如降泽洛桑嘉措、白玛益嘉、喇嘛扎才、降泽阿让、喇嘛洛珠桑波、噶玛蒋扬、昌革活佛、勘布第巴嘉措等。目前有勘布西然、勘布格勒、喇嘛阿曲、勘布益希桑布等。从唐东杰波创建多科寺到迁往却但多之前，这期间一定出现过很多大修行家，但没有详细的资料。历代鄂巴勘布传记中就有有关多科寺的记载，但历代鄂巴勘布的传记目前还没有找到。
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