色喀古陀寺，在山南地区之洛扎县境内，位于县驻地以南、色乡附近，距县城50公里。
色喀古陀寺，亦称“塞卡尔古陀寺”、“色喀谷托”、“桑嘎古托”等。由藏传佛教噶举派的祖师玛尔巴（1012～1097）的著名弟子米拉日巴于 1077～1084年间修建。米拉日巴在西藏宗教历史人物中是一个传奇式的重要人物。米拉日巴（1040～1123）生于后藏的贡塘（今吉隆县以北靠近阿 里的地方），青年时代为报家仇，学了咒术，并以咒术咒杀了35人之多，而且还降下冰雹将全村庄稼毁坏。他为自己造下的恶业而悔恨，决心放弃苯教的修炼，改 信了佛教，并向宁玛派的一位上师学习大圆满法，没有学到精妙之处，于是在38岁时又投入到玛尔巴门下学了六年零八个月。起初玛尔巴为了消除他的罪业，不传 任何密法，并用种种方法“折磨”他，在各种繁重的苦役中他毫无怨言地忍受种种痛苦，“罪障”消除后，玛尔巴大师才给他传法，获得了殊胜成就。后又来到阿里 隐迹山岩间修行了九年，获得风息自在功能。从上他下山云游，以道歌形形式宣扬教义，著有《道情歌集》行世。广收门徒，著名的弟子有热琼巴 （1083～1161）和塔布拉杰（1079～1153）等。
色喀古陀寺就是米拉日巴处学法时修建的。据《米拉日巴传》记载：玛尔巴先让他在东方的山头修建一座圆表的房子，当修到一半时，玛尔巴叫他拆毁， 把土、石运回原处。拆毁以后，玛尔巴又叫他在西蚊山嘴修建一座半圆形的房子，当米拉山巴遵命修到一半时，玛尔巴又命他拆除，还是将土、石运回原处。接着， 米拉日又遵命在北方山头修建三角形的房屋，但修到三分之一时，仍然奉命拆毁了。最后玛尔巴命米拉日巴在玛尔巴父系亲族的公共地上修建一座“灰色的房子”， 九层上面还加一层库房，共有十层。当修到七层的时候，曾遭到玛尔巴族人的反对。由于玛尔巴神变的威力，房屋未被其族人拆毁，仅修到九层。而后米拉日巴又费 了不少力气为玛尔巴修建了一个十二柱的露台和一个暖室。西藏的绘画多在方形建筑的旁边画有圆形、半圆形和三角形，这正是代表色喀古陀寺的修建过程。
色喀古陀寺始建于11世纪，中间几经扩建，才逐步表成现在的规模。现存七层，石墙到顶，四开窗，内有楼梯上下相通，建筑风格独特。除了四方九层 宫外，还有11个佛殿、两层楼的僧舍和院落，主供释迦牟尼镀金铜像和玛尔巴、米拉日巴的泥塑像、噶举佛塔等；寺中还有大量关于噶举派事迹的壁画，据说有的 就是玛尔巴译师的手笔，尤其难得的是该寺还珍藏着大量吐蕃时期手抄本的藏文佛教经典。
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