阿拉善南寺是原来阿拉善地区28座寺庙中的第一大寺，也是藏传佛教格鲁派的重要寺庙。它坐落在阿拉善左旗境内，背倚巍巍的贺兰山主峰，四周有八座群山相拥，远眺呈吉祥八徽。地如八瓣莲花，天似八幅金轮。南有一条小溪婉转潺潺，宛若玉带相绕。雄伟庄严的南寺就在这山环水抱的贺兰山中。
南寺
弥足珍贵的佛教珍宝
此外，在南寺还珍藏有一大批极其珍贵的佛教文物：甘丹赤巴的斗篷；唐朝一代宗师玄奘法师使用过的造型奇特的金刚铃、金刚杵；玛尔巴大师使用过的金刚铃、金刚杵；六世达赖喇嘛的五佛冠；六世班禅所赐的银壹；光绪皇帝御赐的蟒袍、朝珠、玉如意；章嘉大国师制定的寺规；达赖喇嘛、班禅大师赐予封号的诏书、印章，哲蚌寺格斯归（僧官）在传召大法会期间用的铁棒等等……
正因为如此，南寺才红莲盛开，法脉绵长，历经风风雨雨，仍然庄严于风景如画的贺兰山间，令人神往!
十六罗汉夏安居之地
据五世达赖喇嘛《十六罗汉礼供》、六世达赖喇嘛《阿拉善神祭供》、清朝国师章嘉若必多杰呼图克图为南寺所制定的寺规《三学昌盛日光》及南寺第二世葛根罗桑图布丹嘉木苏的《瞻卯山薰香祭》中都分别写到：早在有法术的和尚将十六罗汉迎请到汉地时，于此作过夏安居。而供养十六尊者的施主就是诞生于此地的达摩达喇。据说在南寺附近的特布克山顶留有罗汉们的足迹，至今清晰可见。
情天第一喇嘛——六世达赖喇嘛仓央嘉措的灵塔
历史上的西藏采取的是政教合一的政治体制。历世达赖喇嘛都是最高统治者，班禅次之。可是到了六世达赖喇嘛仓央嘉措在位期间，西藏统治阶层内部矛盾已经十分尖锐。最主要的代表是五世达赖喇嘛的宠臣第巴桑结嘉错（布达拉宫的扩建者）与蒙古和硕特部的固始汗的曾孙、驻藏蒙古军首领拉藏汗之间的斗争，结果第巴桑结嘉措被杀。他所立的六世达赖喇嘛仓央嘉措也被拉藏汗上报朝廷废除了。拉藏汗另立了伊喜嘉措为六世达赖喇嘛，最终藏人不承认。1706年，仓央嘉措被解送北京，次年走至青海湖时，在护法神的帮助下，他施法逃走了，押解人员怕担责任，谎报其途中病逝。至此，一场惊心动魄的统治集团的斗争方告结束。据今比较翔实的史料记载证明，当年只身遁去的六世达赖喇嘛仓央嘉措，化名阿曲扎加措，历时10年游历了印度、西藏、四川、安多、蒙古诸地。
1716年，他第一次莅临今天的阿拉善。由于累世因缘，被当地信众奉为喇嘛师父，并且同当时的阿拉善第二代札萨克阿宝王建立了供施关系。1719年，仓央嘉措大师选定南寺寺址，此后30余年，他奔走于阿拉善和安多之间，弘法利生，鞠躬尽瘁，大转法轮，先后担任了安多地区13座寺庙的法台堪布。特别是重建了年羹尧所率平叛罗布丹津之乱的清军所毁的甘肃天祝的石门寺。1746年，一代宗师、黄教圣主、情天第一喇嘛仓央嘉措大师的色身融入了法界。1756年，经过10年的筹备，遵照仓央嘉措大师的遗嘱，第一世迭斯尔德活佛开始动工兴建南寺。1760年，清乾隆皇帝御赐寺名“广宗寺”，并且授予藏、满、蒙古、汉4种文字的寺名金匾。章嘉大国师应第一世迭斯尔德活佛之邀为南寺制定了寺规。而六世达赖喇嘛圆寂后，其肉身舍利也被建塔供奉于南寺的黄楼庙，成为南寺的镇寺至宝。
1869年，南寺遭受回回叛军的抢劫，并且被放火烧毁。仓央嘉措大师的法体被僧众冒死抢救出来，暂时供奉于衙门寺的药师殿。后来几经周折，在南寺原址上重建新庙，仓央嘉措的法体重又被供奉于南寺。民国二年，重新盖建了大经堂。民国22年，第五世迭斯尔德呼图克图桑结嘉木苏亲自主持修缮扩建了黄楼庙，成为广大僧俗信众的无量福田。
“文革”中，南寺被来自巴彦浩特的造反派们捣毁了，他们逼迫僧人们自己破坏仓央嘉措大师的法体，并且火化掉。当时有个僧人桑杰拉布坦，冒死偷偷地捡收起仓央嘉措大师的骨灰，埋藏起来。1981年，南寺在第六世迭斯尔德活佛——贾拉森仁波切的主持下开始恢复重建工作。1990年7月初，南寺举行新殿开光落成典礼。焕然一新的黄楼庙也重被金饰，再度庄严于吉庆祥瑞的贺兰山中。一代大师仓央嘉措的骨灰舍利重又被装塔供养，再度成为各族信众顶礼膜拜的无尚福田。
两大活佛系统
阿拉善的蒙古族，是清初青海的固始汗吐鲁拜呼的孙子和罗理统领的和硕特
蒙古部落，游牧到此而定居的。300多年来，该部落忠实于朝廷，维护祖国统一，笃信佛教。在第一世迭斯尔德活佛阿旺多尔济著作《六世达赖喇嘛传》中诗赞阿拉善：北有蒙古广袤戈壁，南临华夏富饶农乡；蒙藏汉地在此接壤，世代和睦友好邻邦；条条大路通向四方，贵地汇集福德无量……
至于佛教何时开始在此传播，已经无从考证。但是仓央嘉措大师的数十载弘法，却使得阿拉善地区的佛教发展进入了兴盛时期，进而在南寺形成了两大活佛系统。如果说四世达赖喇嘛出生在内蒙古，是迄今为止唯一的蒙古族黄教教主，这已经让辽阔的蒙古高原荣光无限，而六世达赖喇嘛仓央嘉措大师将大半生献身于内蒙古阿拉善地区的弘法利生事业，更使得这片蓝色的蒙古高原佛光万丈、千年吉祥。
阿拉善南寺的两大活佛转世系统分别是：六世达赖喇嘛仓央嘉措转世系统和第巴桑结嘉措转世系统。他们都是大清王朝和民国政府册封的呼图克图，也是南寺的寺主活佛，对寺院和属寺的一切宗教活动及各种事物拥有至高无上的决策权。
仓央嘉措大师的转世系统又称葛根转世系统，其历代转世均受到达赖喇嘛、班禅大师赐予的“伊拉古克桑班迪达贡卓若们汗”和“达格布呼图克图”的封号。葛根喇嘛是阿拉善的最大活佛。
第一世葛根喇嘛是六世达赖仓央嘉措。
第二世葛根喇嘛罗桑图布丹嘉木苏，即温都尔葛根，俗名元旦忠乃。该葛根喇嘛佛像绘制艺术造诣颇深，南寺及其属寺曾供奉其亲手绘制的七轴护法拉姆唐卡，瞻卯山洞也有他亲手绘制的佛像。
第三世葛根喇嘛却达尔嘉木苏，又名仁钦嘉木苏，6岁迎请至南寺坐床。1828年6月28日圆寂于前往安多的途中。灵骨舍利供奉于甘肃天祝的石门寺宝塔中。
第四世葛根喇嘛伊希楚勒图木达尔吉嘉木苏，1829年6月6日生于阿拉善额尔克哈什格巴嘎的策策格图淖尔的一个牧民家中。通过雍和宫金瓶掣签确认，于1834年受戒坐床，13岁进藏学经，1850年11月6日圆寂，享年21岁。
第五世葛根喇嘛贡萨勒永恰布，生于1851年10月4日，16岁迎请到南寺坐床。是当时阿拉善王爷贡桑居穆德的三子，所以僧俗信众又称其“三爷葛根”。
第六世葛根喇嘛阿旺丹增天来嘉木苏，1901年12月30日生于阿拉善通胡巴嘎的毛道尔格家。该葛根喇嘛思想激进，不满旗政，与旧政府不合，后秘密出走，一直没回来。1958年圆寂于锡林郭勒盟镶黄旗，享年57岁。
由于历史原因，作为内蒙古和藏传佛教非常重要的转世活佛系统，该活佛的转世灵童寻访认定工作至今还没有进行。
南寺的另一转世活佛系统是第巴桑结嘉措的转世系统。因为蒙古语发音为“迭斯尔德”，故这一系统活佛习惯称谓为迭斯尔德呼图克图，通称“喇嘛坦”。
第一世喇嘛坦是六世达赖喇嘛仓央嘉措确认的阿旺多尔济，也叫阿旺伦珠达尔吉。他自幼跟随仓央嘉措大师出家，主要功绩是遵照仓央嘉措大师的遗嘱修建了南寺，安置保存了仓央嘉措大师的法体，寻找确认了六世达赖喇嘛仓央嘉措的转世灵童。第一世迭斯尔德活佛是一位显密圆融的一代高僧大德，也是阿拉善的第一位转世活佛，同时是阿拉善第一位用藏文著书的蒙古族活佛。其代表作是六世达赖喇嘛的传记《妙音天界琵琶音》，其圆寂前曾吟唱的一首歌，成了后人流行的蒙古族民歌《轮回》，其中主要阐释的是佛教的生死轮回、因果报应的教义，至今仍然广泛流传。
第二世喇嘛坦伦珠布达尔吉，1784年生于安多藏族家庭，9岁圆寂，未能迎请到寺庙坐床。
第三世喇嘛坦丹增忠乃达尔吉，1793年生于阿拉善巴润别立巴嘎。他在南寺设立了参尼扎仓，即法相僧院，这奠定了南寺学经、辩经、考取学位制度的基础。
第四世喇嘛坦是阿旺丹巴达尔吉嘉木苏，1857生于阿拉善厢根达来巴嘎，是协理那仁达来之子，迎请到南寺坐床不久就圆寂了。
第五世喇嘛坦，敖木察尔山潘普勒忠桑吉嘉木苏，别名仓赛夏特比多杰、拉尊那木吉勒道尔吉，29岁入藏学经，精通显密教法，是阿拉善近代史上著名的佛学大德，与教主十三世达赖喇嘛关系甚密。达赖喇嘛和班禅大师都授予他“阿日鲁克桑班迪达额尔德尼诺门罕”的封号。1928年，因为阿拉善政局动荡，旗王爷塔旺布鲁克吉拉居住北京不回，应王爷之邀和衙门众人推举，第五世喇嘛坦掌管旗政府工作4年，这也是阿拉善唯一的一次政教合一时期。
第五世喇嘛坦对南寺的发展起到了重要作用。他主持扩建维修了六世达赖喇嘛灵塔大殿，选派众多僧人入藏学经，努力提高全寺僧人的佛学造诣，积极营造学修经论的氛围；主持邀请九世班禅却吉尼玛大师来寺讲经传法；应十三世达赖喇嘛之命设立五供祈愿法会，经常为僧众授戒，讲经说法，传授密宗灌顶……
第六世喇嘛坦阿旺罗桑丹比坚参，意为“语自在善慧教法胜利幢”，人们习惯称为“贾拉森仁波切”，3岁时被迎请至阿拉善，5岁正式出家受戒坐床，拜香巴丹曾为师，开始了背诵经文和藏文的学习，自12岁起，在各级政府的关怀下，进入小学学习，一直到内大研究生毕业，后又留学日本，现为内蒙古大学蒙古学院教授、博士生导师，内蒙古佛协会长、全国佛协常务理事，全国政协委员。
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